Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms