Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan11Q9D1D1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms