Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q9D131 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q9D131 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Q9D131 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q9D131 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9D131 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms