Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms