Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shmt2Q9CZN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms