Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms