Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd12Q9CWU0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms