Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms