Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sft2d3Q9CSV6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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