Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms