Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Msmo1Q9CRA4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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