Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR63

Cox16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox16Q9CR63 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox16Q9CR63 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox16Q9CR63 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms