Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg12Q9CQY1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms