Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim8Q9CQQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms