Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms