Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp6v0e1Q9CQD8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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