Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQ90 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQ90 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms