Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms