Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brms1Q99N20 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms