Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hdac9Q99N13 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms