Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf17Q99MV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf17Q99MV7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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