Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PccbQ99MN9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PccbQ99MN9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PccbQ99MN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PccbQ99MN9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms