Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dok4Q99KE3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dok4Q99KE3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms