Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp11Q99K46 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms