Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim11aQ99J19 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim11aQ99J19 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim11aQ99J19 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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