Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn16Q925N4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn16Q925N4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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