Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q922R1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q922R1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q922R1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q922R1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q922R1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q922R1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms