Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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NelfcdQ922L6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfcdQ922L6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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