Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Afg3l1Q920A7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l1Q920A7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms