Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pde6cQ91ZQ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pde6cQ91ZQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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