Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpm2Q91YD4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms