Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp3Q91W36 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms