Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dkk4Q8VEJ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dkk4Q8VEJ3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms