Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD75

Hip1, Huntingtin-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1Q8VD75 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hip1Q8VD75 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hip1Q8VD75 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms