Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Impg1Q8R1W8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Impg1Q8R1W8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms