Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hecw1Q8K4P8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hecw1Q8K4P8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms