Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms