Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FgbQ8K0E8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FgbQ8K0E8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms