Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnma3Q8JZW8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnma3Q8JZW8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms