Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog3Q8CI04 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms