Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rdh13Q8CEE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rdh13Q8CEE7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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