Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vcpip1Q8CDG3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms