Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SynpoQ8CC35 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SynpoQ8CC35 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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