Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ephb1Q8CBF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms