Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FarsaQ8C0C7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms