Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccser1Q8C0C4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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