Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Usp47Q8BY87 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp47Q8BY87 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp47Q8BY87 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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