Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx17Q8BVL3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx17Q8BVL3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx17Q8BVL3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Snx17Q8BVL3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx17Q8BVL3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms