Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup54Q8BTS4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms