Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp54Q8BL06 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp54Q8BL06 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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